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高性能計(jì)算
背景簡介
隨著信息化社會(huì)的飛速發(fā)展，人們對(duì)于信息處理能力的要求越來越高，高性能計(jì)算系統(tǒng)的應(yīng)用更加廣泛，不僅在航天、國防、天氣預(yù)報(bào)、生命科學(xué)等占據(jù)重要位置，工業(yè)、金融、企業(yè)等領(lǐng)域?qū)Ω咝阅苡?jì)算的需求也在迅猛增長。
特別是隨著高性能計(jì)算、大數(shù)據(jù)分析應(yīng)用的越來越廣泛，HPC的商用化同樣也在加速。面對(duì)越來越廣泛的市場需求，Dell 高性能解決方案推出了多檔解決方案，降低了高性能運(yùn)算方案的使用復(fù)雜度，同時(shí)還將高性能計(jì)算市場化 、商用化、普及化，以滿足各種層次用戶的應(yīng)用需求。
方案概述
高性能計(jì)算基礎(chǔ)架構(gòu)：
管理節(jié)點(diǎn)/登錄節(jié)點(diǎn)
計(jì)算節(jié)點(diǎn)
管理網(wǎng)絡(luò)/IO網(wǎng)絡(luò)
存儲(chǔ)
集群管理軟件/任務(wù)調(diào)度軟件
初創(chuàng)型企業(yè)
配置清單
管理/數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)
S3124：
S3124, L3, 24x 1GbE, 2x組合, 2x 10GbES
FP+ 固定端口
S3124, L3, 24x 1GbE, 2x組合, 2x 10GbES
FP+ 固定端口
計(jì)算節(jié)點(diǎn)/存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)
730xd:
英特爾? 至強(qiáng)? E5-2650 v4 *2/16GB DDR4*8/H730P/300G 10k*2+6TB NLSAS*12/x520DP+i350DP/3年P(guān)roSupport Plus4hr
英特爾? 至強(qiáng)? E5-2650 v4 *2/16GB DDR4*8/H730P/300G 10k*2+6TB NLSAS*12/x520DP+i350DP/3年P(guān)roSupport Plus4hr
集群管理軟件/任務(wù)調(diào)度軟件
Rocks/BCM/PBS works
DELL 優(yōu)勢(shì)
單臺(tái)提供691Gflops的浮點(diǎn)運(yùn)算能力
12塊6TB NLSAS硬盤配置raid5，提供接近于66TB的可用容量，提供接近于2GB/s的順序讀,1.8GB/s的順序?qū)?/div>
S3124交換機(jī)提供專為無阻塞訪問而設(shè)計(jì)的高性能管理型以太網(wǎng)交換機(jī)，S3124交換機(jī)的數(shù)據(jù)速率高達(dá)212 Gbps（全雙工）轉(zhuǎn)發(fā)速率高達(dá)158 Mpps，足以保證性能
可選擇開源集群管理軟件Rocks，及企業(yè)級(jí)集群管理及任務(wù)調(diào)度軟件BCM
簡單標(biāo)準(zhǔn)架構(gòu)提供給初創(chuàng)企業(yè)性價(jià)比
中小型企業(yè)
配置清單
idrac管理網(wǎng)絡(luò)：Networking X1052?交換機(jī)
集群管理網(wǎng)絡(luò)：Networking N2048?交換機(jī)
數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)：Networking S4048?交換機(jī)
登錄/管理節(jié)點(diǎn)：PowerEdge?R430
計(jì)算節(jié)點(diǎn)：PowerEdge R630
存儲(chǔ)節(jié)點(diǎn)：PowerEdge?R730，PowerVault MD3460
集群管理軟件/任務(wù)調(diào)度軟件：
Rocks/BCM/PBS works
Rocks/BCM/PBS works
DELL 優(yōu)勢(shì)
單臺(tái)提供691Gflops的浮點(diǎn)運(yùn)算能力，8臺(tái)R630集群提供5.5Tflops的浮點(diǎn)運(yùn)算能力
60塊6TB NLSAS硬盤，分成6組，每組10塊，每組配置raid6，可用容量為288TB，順序讀峰值3.3GB/s，順序?qū)懛逯禐?GB/s，使用XFS的文件系統(tǒng)和LVM邏輯卷功能提供統(tǒng)一命名空間
S3148交換機(jī)提供專為無阻塞訪問而設(shè)計(jì)的高性能管理型以太網(wǎng)交換機(jī)，S3148交換機(jī)的數(shù)據(jù)速率高達(dá)260 Gbps（全雙工），轉(zhuǎn)發(fā)速率高達(dá)193 Mpps，足以保證性能
獨(dú)立的idrac硬件管理網(wǎng)絡(luò)，集群管理網(wǎng)絡(luò)，數(shù)據(jù)傳輸網(wǎng)絡(luò)
可選擇開源集群管理軟件Rocks，及企業(yè)級(jí)集群管理及任務(wù)調(diào)度軟件BCM
更具性價(jià)比的300TB內(nèi)HPCC解決方案
方案收益
- 公司效益提升
可提供高效的運(yùn)算能力
大幅度提高運(yùn)算效率 - 成熟穩(wěn)定的平臺(tái)
給客戶提供更可靠
穩(wěn)定的產(chǎn)品組合 - 有效降低TCO
節(jié)省了客戶的電力成本，提供更佳
性價(jià)比以及靈活的擴(kuò)展能
力；降低IT維護(hù)成本
方案案例 —— HPCC生命科學(xué)云平臺(tái)
背景介紹
客戶是一家基于高通量測(cè)序和生物信息技術(shù)的開發(fā)與應(yīng)用，開展以醫(yī)學(xué)檢測(cè)、科研外包服務(wù)、生物云平臺(tái)和分子育種為主體業(yè)務(wù)的高科技公司?？蛻粝ＭM(jìn)一步提升平臺(tái)整體運(yùn)算能力，并且對(duì)外發(fā)布其生物運(yùn)算云平臺(tái)供各高校及相關(guān)研究機(jī)構(gòu)運(yùn)算。
用戶需求
性能、高IO：浮點(diǎn)運(yùn)算能力要強(qiáng)，因?yàn)楦咄康臏y(cè)序需要對(duì)幾十萬到幾百萬條DNS分子進(jìn)行序列測(cè)定，其過程十分復(fù)雜，唯有強(qiáng)大的浮點(diǎn)運(yùn)算能力才能滿足客戶的需求，同時(shí)高的運(yùn)算能力需要高I/O吞吐以確保海量計(jì)算數(shù)據(jù)的傳輸效率。
高效網(wǎng)絡(luò)：需要滿足HPCC運(yùn)算平臺(tái)和openstack云平臺(tái)的高吞吐、低延遲、高靈活性、高密度、高能源效率的網(wǎng)絡(luò)。
易于擴(kuò)展：HPCC系統(tǒng)架構(gòu)需求先進(jìn)，需要采用標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)和開放先進(jìn)的架構(gòu)，以保障未來的平滑升級(jí)。
服務(wù)周全：HPCC項(xiàng)目建設(shè)是一項(xiàng)復(fù)雜的系統(tǒng)工程，涉及面廣而且技術(shù)門檻高，HPCC方案的供應(yīng)商必須全面承擔(dān)起前期系統(tǒng)的規(guī)劃與咨詢、實(shí)施、技術(shù)支持，提供端到端的解決方案，而且要易于維護(hù)和管理，以減輕運(yùn)維人員的負(fù)擔(dān)。
Dell 方案
我們?yōu)榭蛻袅可泶蛟炝艘粋€(gè)高性能、高IO、易用、易于擴(kuò)展且服務(wù)周全的HPCC方案。
在高性能方面新增了70臺(tái)配置了Intel? Xeon? Processor E5-2670 v3處理器的戴爾PowerEdge R630機(jī)架式服務(wù)器作為瘦計(jì)算節(jié)點(diǎn)，提供了高達(dá)64.6TFlops的運(yùn)算能力，MD3460結(jié)合MD3060e提供了接近于14GB的IO和2.88PB的總?cè)萘浚?/div>
在核心網(wǎng)絡(luò)方面，采用強(qiáng)大的高吞吐低延遲132口全40Gb的Z9500，提升整體計(jì)算IO性能；
在未來擴(kuò)張性方面，Z9500預(yù)留了一半的接口供客戶后期擴(kuò)展，Intel Iustre文件系統(tǒng)的橫向擴(kuò)展能力保證了IO的升級(jí)；
在技術(shù)支持方面，我們提供了HPCC和openstack項(xiàng)目前期建設(shè)與規(guī)劃，中期現(xiàn)場系統(tǒng)部署，后期PSP白金級(jí)技術(shù)支持的全生命周期的周全服務(wù)。
配置清單
拓?fù)鋱D
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