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高性能計算
背景簡介
隨著信息化社會的飛速發(fā)展，人們對于信息處理能力的要求越來越高，高性能計算系統(tǒng)的應用更加廣泛，不僅在航天、國防、天氣預報、生命科學等占據(jù)重要位置，工業(yè)、金融、企業(yè)等領域?qū)Ω咝阅苡嬎愕男枨笠苍谘该驮鲩L。
特別是隨著高性能計算、大數(shù)據(jù)分析應用的越來越廣泛，HPC的商用化同樣也在加速。面對越來越廣泛的市場需求，Dell 高性能解決方案推出了多檔解決方案，降低了高性能運算方案的使用復雜度，同時還將高性能計算市場化 、商用化、普及化，以滿足各種層次用戶的應用需求。
方案概述
高性能計算基礎架構：
管理節(jié)點/登錄節(jié)點
計算節(jié)點
管理網(wǎng)絡/IO網(wǎng)絡
存儲
集群管理軟件/任務調(diào)度軟件
初創(chuàng)型企業(yè)
配置清單
管理/數(shù)據(jù)網(wǎng)絡
S3124：
S3124, L3, 24x 1GbE, 2x組合, 2x 10GbES
FP+ 固定端口
S3124, L3, 24x 1GbE, 2x組合, 2x 10GbES
FP+ 固定端口
計算節(jié)點/存儲節(jié)點
730xd:
英特爾? 至強? E5-2650 v4 *2/16GB DDR4*8/H730P/300G 10k*2+6TB NLSAS*12/x520DP+i350DP/3年ProSupport Plus4hr
英特爾? 至強? E5-2650 v4 *2/16GB DDR4*8/H730P/300G 10k*2+6TB NLSAS*12/x520DP+i350DP/3年ProSupport Plus4hr
集群管理軟件/任務調(diào)度軟件
Rocks/BCM/PBS works
DELL 優(yōu)勢
單臺提供691Gflops的浮點運算能力
中小型企業(yè)
配置清單
idrac管理網(wǎng)絡：Networking X1052?交換機
集群管理網(wǎng)絡：Networking N2048?交換機
數(shù)據(jù)網(wǎng)絡：Networking S4048?交換機
登錄/管理節(jié)點：PowerEdge?R430
計算節(jié)點：PowerEdge R630
存儲節(jié)點：PowerEdge?R730，PowerVault MD3460
集群管理軟件/任務調(diào)度軟件：
Rocks/BCM/PBS works
Rocks/BCM/PBS works
DELL 優(yōu)勢
單臺提供691Gflops的浮點運算能力，8臺R630集群提供5.5Tflops的浮點運算能力
60塊6TB NLSAS硬盤，分成6組，每組10塊，每組配置raid6，可用容量為288TB，順序讀峰值3.3GB/s，順序?qū)懛逯禐?GB/s，使用XFS的文件系統(tǒng)和LVM邏輯卷功能提供統(tǒng)一命名空間
S3148交換機提供專為無阻塞訪問而設計的高性能管理型以太網(wǎng)交換機，S3148交換機的數(shù)據(jù)速率高達260 Gbps（全雙工），轉(zhuǎn)發(fā)速率高達193 Mpps，足以保證性能
獨立的idrac硬件管理網(wǎng)絡，集群管理網(wǎng)絡，數(shù)據(jù)傳輸網(wǎng)絡
可選擇開源集群管理軟件Rocks，及企業(yè)級集群管理及任務調(diào)度軟件BCM
更具性價比的300TB內(nèi)HPCC解決方案
方案收益
- 公司效益提升
可提供高效的運算能力
大幅度提高運算效率 - 成熟穩(wěn)定的平臺
給客戶提供更可靠
穩(wěn)定的產(chǎn)品組合 - 有效降低TCO
節(jié)省了客戶的電力成本，提供更佳
性價比以及靈活的擴展能
力；降低IT維護成本
方案案例 —— HPCC生命科學云平臺
背景介紹
客戶是一家基于高通量測序和生物信息技術的開發(fā)與應用，開展以醫(yī)學檢測、科研外包服務、生物云平臺和分子育種為主體業(yè)務的高科技公司?？蛻粝ＭM一步提升平臺整體運算能力，并且對外發(fā)布其生物運算云平臺供各高校及相關研究機構運算。
用戶需求
性能、高IO：浮點運算能力要強，因為高通量的測序需要對幾十萬到幾百萬條DNS分子進行序列測定，其過程十分復雜，唯有強大的浮點運算能力才能滿足客戶的需求，同時高的運算能力需要高I/O吞吐以確保海量計算數(shù)據(jù)的傳輸效率。
高效網(wǎng)絡：需要滿足HPCC運算平臺和openstack云平臺的高吞吐、低延遲、高靈活性、高密度、高能源效率的網(wǎng)絡。
易于擴展：HPCC系統(tǒng)架構需求先進，需要采用標準化技術和開放先進的架構，以保障未來的平滑升級。
服務周全：HPCC項目建設是一項復雜的系統(tǒng)工程，涉及面廣而且技術門檻高，HPCC方案的供應商必須全面承擔起前期系統(tǒng)的規(guī)劃與咨詢、實施、技術支持，提供端到端的解決方案，而且要易于維護和管理，以減輕運維人員的負擔。
Dell 方案
我們?yōu)榭蛻袅可泶蛟炝艘粋€高性能、高IO、易用、易于擴展且服務周全的HPCC方案。
在高性能方面新增了70臺配置了Intel? Xeon? Processor E5-2670 v3處理器的戴爾PowerEdge R630機架式服務器作為瘦計算節(jié)點，提供了高達64.6TFlops的運算能力，MD3460結合MD3060e提供了接近于14GB的IO和2.88PB的總容量；
在核心網(wǎng)絡方面，采用強大的高吞吐低延遲132口全40Gb的Z9500，提升整體計算IO性能；
在未來擴張性方面，Z9500預留了一半的接口供客戶后期擴展，Intel Iustre文件系統(tǒng)的橫向擴展能力保證了IO的升級；
在技術支持方面，我們提供了HPCC和openstack項目前期建設與規(guī)劃，中期現(xiàn)場系統(tǒng)部署，后期PSP白金級技術支持的全生命周期的周全服務。
配置清單
拓撲圖
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